Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

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Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
KDM6BO15054 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
KDM6BO15054 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.28■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
KDM6BO15054 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KDM6BO15054 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
KDM6BO15054 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
KDM6BO15054 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KDM6BO15054 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
KDM6BO15054 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC42■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
KDM6BO15054 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
KDM6BO15054 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
KDM6BO15054 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
KDM6BO15054 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
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