Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAPN9O14815 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPN9O14815 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN9O14815 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAPN9O14815 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAPN9O14815 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN9O14815 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAPN9O14815 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms