Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9A3R1O14745 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9A3R1O14745 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC9A3R1O14745 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC9A3R1O14745 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC9A3R1O14745 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3R1O14745 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC9A3R1O14745 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms