Protein–RNA interactions for Protein: O14639

ABLIM1, Actin-binding LIM protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM1O14639 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABLIM1O14639 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABLIM1O14639 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABLIM1O14639 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABLIM1O14639 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABLIM1O14639 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABLIM1O14639 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABLIM1O14639 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABLIM1O14639 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABLIM1O14639 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABLIM1O14639 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABLIM1O14639 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms