Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 RCSD1-205ENST00000475127 939 ntTSL 221.07■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 75
DDX3XO00571 RCSD1-204ENST00000472038 1719 ntTSL 220.39■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 75
DDX3XO00571 RCSD1-203ENST00000461790 932 ntTSL 217.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 75
DDX3XO00571 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-27■■■■■ 74.8
DDX3XO00571 GTF3A-205ENST00000466776 461 ntTSL 511.89□□□□□ -0.511e-27■■■■■ 74.8
DDX3XO00571 MELTF-205ENST00000473501 2757 ntTSL 223■■□□□ 1.278e-11■■■■■ 74.7
DDX3XO00571 TGFBR1-207ENST00000549766 1678 ntTSL 526.5■■□□□ 1.834e-12■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.114e-12■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.864e-12■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.574e-12■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 TGFBR1-204ENST00000547314 533 ntTSL 46.31□□□□□ -1.44e-12■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 TGFBR1-210ENST00000552573 526 ntTSL 43.16□□□□□ -1.94e-12■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 CD24-205ENST00000619869 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.86■□□□□ 0.932e-11■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.912e-11■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.612e-11■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 CD24-203ENST00000615659 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.27□□□□□ -1.092e-11■■■■■ 74.6
DDX3XO00571 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.697e-19■■■■■ 74.5
DDX3XO00571 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.557e-19■■■■■ 74.5
DDX3XO00571 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.167e-19■■■■■ 74.5
DDX3XO00571 NTAN1-202ENST00000563940 354 ntTSL 57.79□□□□□ -1.162e-43■■■■■ 74.3
DDX3XO00571 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)25.29■■□□□ 1.642e-46■■■■■ 74.2
DDX3XO00571 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 74
DDX3XO00571 SERPINE2-207ENST00000454956 546 ntTSL 417.64■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 74
DDX3XO00571 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 74
DDX3XO00571 SERPINE2-210ENST00000489065 563 ntTSL 214.18□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 74
DDX3XO00571 SELENOW-211ENST00000599874 636 ntTSL 217■□□□□ 0.314e-14■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-213ENST00000601419 717 ntTSL 216.32■□□□□ 0.24e-14■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-209ENST00000599590 572 ntTSL 415.01□□□□□ -0.012e-20■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.024e-14■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.024e-14■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.024e-14■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-14■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-208ENST00000599302 636 ntTSL 313.21□□□□□ -0.292e-20■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.414e-14■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 CNOT7-210ENST00000523649 699 ntTSL 216.61■□□□□ 0.252e-16■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.032e-16■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-16■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 CNOT7-206ENST00000519954 1209 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-16■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 CNOT7-202ENST00000518021 768 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-16■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-16■■■■■ 73.8
DDX3XO00571 PPIC-202ENST00000415659 1143 ntTSL 217.07■□□□□ 0.323e-23■■■■■ 73.6
DDX3XO00571 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-23■■■■■ 73.6
DDX3XO00571 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-16■■■■■ 73.5
DDX3XO00571 SLC35F2-202ENST00000524991 562 ntTSL 421.7■■□□□ 1.062e-15■■■■■ 73.1
DDX3XO00571 SLC35F2-205ENST00000532513 1028 ntTSL 519.38■□□□□ 0.692e-15■■■■■ 73.1
DDX3XO00571 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-15■■■■■ 73.1
DDX3XO00571 SLC35F2-206ENST00000533664 1007 ntTSL 217.02■□□□□ 0.322e-15■■■■■ 73.1
DDX3XO00571 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-15■■■■■ 73.1
DDX3XO00571 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 72.8
DDX3XO00571 GUK1-231ENST00000485859 325 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.537e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.417e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.47e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-228ENST00000485168 737 ntTSL 316.36■□□□□ 0.217e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-219ENST00000470040 2548 ntTSL 216.28■□□□□ 0.27e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-237ENST00000495999 555 ntTSL 316.04■□□□□ 0.167e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 515.92■□□□□ 0.147e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 214.97□□□□□ -0.017e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 314.22□□□□□ -0.137e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 514.1□□□□□ -0.157e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-223ENST00000478725 414 ntTSL 313.94□□□□□ -0.187e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 313.68□□□□□ -0.227e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-232ENST00000486668 738 ntTSL 313.42□□□□□ -0.267e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 313.3□□□□□ -0.287e-27■■■■■ 72.4
DDX3XO00571 ASRGL1-209ENST00000534183 1177 ntTSL 1 (best)25.62■■□□□ 1.694e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.444e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.324e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 ASRGL1-203ENST00000525496 565 ntTSL 220.72■□□□□ 0.914e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.774e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 ASRGL1-205ENST00000526096 535 ntTSL 319.58■□□□□ 0.724e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 ASRGL1-207ENST00000529226 574 ntTSL 419.04■□□□□ 0.644e-11■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 RBM17-203ENST00000432931 805 ntTSL 321.83■■□□□ 1.092e-17■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.682e-17■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 RBM17-204ENST00000437845 833 ntTSL 319.01■□□□□ 0.632e-17■■■■■ 72.2
DDX3XO00571 SMPD1-205ENST00000531303 1451 ntTSL 1 (best)20.22■□□□□ 0.831e-11■■■■■ 71.9
DDX3XO00571 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.611e-16■■■■■ 71.8
DDX3XO00571 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.561e-16■■■■■ 71.8
DDX3XO00571 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 528.62■■■□□ 2.173e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 BPHL-206ENST00000430655 2157 ntTSL 1 (best)25.91■■□□□ 1.741e-7■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 225.08■■□□□ 1.63e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 BPHL-205ENST00000424847 1563 ntTSL 1 (best)24.93■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 224.06■■□□□ 1.443e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 524.01■■□□□ 1.433e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)23.5■■□□□ 1.353e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 BPHL-207ENST00000433912 1063 ntTSL 220.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 BPHL-210ENST00000479273 607 ntTSL 419.5■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.123e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 BPHL-212ENST00000490918 3723 ntTSL 212.83□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-213ENST00000522610 1341 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.413e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.463e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-208ENST00000520008 725 ntTSL 211.78□□□□□ -0.521e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-201ENST00000265421 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-217ENST00000532157 675 ntTSL 310.83□□□□□ -0.681e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-204ENST00000518925 983 ntTSL 510.04□□□□□ -0.81e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.933e-17■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-205ENST00000519094 561 ntTSL 39.2□□□□□ -0.941e-14■■■■■ 71.6
DDX3XO00571 POLB-212ENST00000522297 591 ntTSL 28.9□□□□□ -0.981e-14■■■■■ 71.6
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