Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCRL2O00421 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCRL2O00421 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCRL2O00421 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CCRL2O00421 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCRL2O00421 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCRL2O00421 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCRL2O00421 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms