Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A7O00341 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A7O00341 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A7O00341 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC1A7O00341 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC1A7O00341 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC1A7O00341 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A7O00341 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A7O00341 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A7O00341 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms