Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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