Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RFXAPO00287 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RFXAPO00287 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RFXAPO00287 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RFXAPO00287 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RFXAPO00287 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RFXAPO00287 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RFXAPO00287 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RFXAPO00287 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RFXAPO00287 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms