Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMD12O00232 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMD12O00232 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMD12O00232 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMD12O00232 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSMD12O00232 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMD12O00232 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms