Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AP3B1O00203 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP3B1O00203 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP3B1O00203 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3B1O00203 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3B1O00203 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B1O00203 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms