Protein–RNA interactions for Protein: J3QL48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QL48 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QL48 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QL48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QL48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QL48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QL48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QL48 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QL48 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QL48 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QL48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QL48 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QL48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QL48 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QL48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QL48 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QL48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QL48 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QL48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QL48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QL48 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QL48 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QL48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QL48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QL48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QL48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QL48 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QL48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QL48 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QL48 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QL48 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3QL48 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QL48 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QL48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QL48 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QL48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QL48 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3QL48 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QL48 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QL48 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3QL48 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3QL48 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QL48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QL48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QL48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QL48 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3QL48 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QL48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QL48 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QL48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QL48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
J3QL48 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QL48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QL48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
J3QL48 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QL48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QL48 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
J3QL48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QL48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QL48 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QL48 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QL48 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QL48 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
J3QL48 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QL48 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QL48 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QL48 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
J3QL48 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QL48 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QL48 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QL48 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QL48 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
J3QL48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QL48 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QL48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QL48 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
J3QL48 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QL48 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QL48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
J3QL48 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QL48 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QL48 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QL48 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QL48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QL48 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
J3QL48 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QL48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms