Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
J3KTA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
J3KTA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
J3KTA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
J3KTA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
J3KTA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KTA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KTA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3KTA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
J3KTA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KTA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KTA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KTA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KTA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KTA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
J3KTA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
J3KTA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
J3KTA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
J3KTA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
J3KTA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
J3KTA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
J3KTA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
J3KTA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
J3KTA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
J3KTA2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
J3KTA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
J3KTA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
J3KTA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
J3KTA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
J3KTA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
J3KTA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
J3KTA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
J3KTA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
J3KTA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
J3KTA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
J3KTA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
J3KTA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
J3KTA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
J3KTA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
J3KTA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
J3KTA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
J3KTA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
J3KTA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
J3KTA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
J3KTA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3KTA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3KTA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
J3KTA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3KTA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3KTA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
J3KTA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3KTA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3KTA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3KTA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3KTA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3KTA2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
J3KTA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
J3KTA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KTA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
J3KTA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3KTA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3KTA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3KTA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
J3KTA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
J3KTA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
J3KTA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
J3KTA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KTA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KTA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
J3KTA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KTA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KTA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
J3KTA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
J3KTA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KTA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KTA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
J3KTA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
J3KTA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
J3KTA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
J3KTA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
J3KTA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KTA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KTA2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
J3KTA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3KTA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
J3KTA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
J3KTA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KTA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KTA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
J3KTA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KTA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
J3KTA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms