Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STMND1H3BQB6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STMND1H3BQB6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STMND1H3BQB6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STMND1H3BQB6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STMND1H3BQB6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STMND1H3BQB6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STMND1H3BQB6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STMND1H3BQB6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STMND1H3BQB6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STMND1H3BQB6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STMND1H3BQB6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STMND1H3BQB6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STMND1H3BQB6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms