Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4DXG7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4DXG7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4DXG7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4DXG7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4DXG7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4DXG7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
B4DXG7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4DXG7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4DXG7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B4DXG7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B4DXG7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4DXG7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B4DXG7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4DXG7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B4DXG7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
B4DXG7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4DXG7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B4DXG7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4DXG7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4DXG7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B4DXG7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4DXG7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4DXG7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4DXG7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4DXG7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B4DXG7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4DXG7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B4DXG7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4DXG7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B4DXG7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B4DXG7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4DXG7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4DXG7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4DXG7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4DXG7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B4DXG7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4DXG7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4DXG7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B4DXG7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DXG7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DXG7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DXG7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DXG7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DXG7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B4DXG7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DXG7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DXG7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DXG7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DXG7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
B4DXG7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4DXG7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4DXG7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4DXG7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B4DXG7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DXG7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DXG7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DXG7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DXG7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DXG7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B4DXG7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4DXG7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4DXG7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B4DXG7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DXG7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DXG7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DXG7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B4DXG7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
B4DXG7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
B4DXG7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DXG7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DXG7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DXG7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DXG7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DXG7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DXG7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B4DXG7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
B4DXG7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DXG7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DXG7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DXG7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B4DXG7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DXG7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B4DXG7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DXG7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DXG7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DXG7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DXG7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4DXG7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DXG7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DXG7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DXG7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4DXG7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DXG7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DXG7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DXG7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4DXG7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4DXG7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4DXG7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4DXG7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms