Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF879B4DU55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF879B4DU55 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF879B4DU55 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF879B4DU55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF879B4DU55 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF879B4DU55 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF879B4DU55 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms