Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERPINE3A8MV23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SERPINE3A8MV23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINE3A8MV23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SERPINE3A8MV23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINE3A8MV23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms