Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYSRT1A8MQ03 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYSRT1A8MQ03 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYSRT1A8MQ03 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYSRT1A8MQ03 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYSRT1A8MQ03 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYSRT1A8MQ03 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYSRT1A8MQ03 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms