Protein–RNA interactions for Protein: A6NN06

Putative UPF0633 protein MGC21881, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NN06 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
A6NN06 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
A6NN06 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
A6NN06 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
A6NN06 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A6NN06 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A6NN06 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
A6NN06 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A6NN06 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
A6NN06 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
A6NN06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
A6NN06 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
A6NN06 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
A6NN06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
A6NN06 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
A6NN06 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A6NN06 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A6NN06 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
A6NN06 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
A6NN06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
A6NN06 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
A6NN06 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A6NN06 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A6NN06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
A6NN06 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
A6NN06 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A6NN06 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
A6NN06 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A6NN06 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A6NN06 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
A6NN06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A6NN06 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
A6NN06 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
A6NN06 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
A6NN06 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A6NN06 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A6NN06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A6NN06 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A6NN06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A6NN06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A6NN06 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A6NN06 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A6NN06 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A6NN06 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A6NN06 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A6NN06 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A6NN06 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A6NN06 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A6NN06 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A6NN06 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A6NN06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A6NN06 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A6NN06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A6NN06 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A6NN06 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A6NN06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A6NN06 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A6NN06 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A6NN06 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A6NN06 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A6NN06 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A6NN06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A6NN06 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A6NN06 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A6NN06 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A6NN06 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A6NN06 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A6NN06 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A6NN06 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
A6NN06 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
A6NN06 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
A6NN06 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
A6NN06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
A6NN06 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
A6NN06 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
A6NN06 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
A6NN06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
A6NN06 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A6NN06 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A6NN06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A6NN06 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A6NN06 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
A6NN06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A6NN06 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A6NN06 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
A6NN06 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms