Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU0

RFPL4A, Ret finger protein-like 4A, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4AA6NLU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4AA6NLU0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4AA6NLU0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFPL4AA6NLU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFPL4AA6NLU0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL4AA6NLU0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFPL4AA6NLU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFPL4AA6NLU0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFPL4AA6NLU0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFPL4AA6NLU0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL4AA6NLU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL4AA6NLU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms