Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PCNX2A6NKB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCNX2A6NKB5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNX2A6NKB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNX2A6NKB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PCNX2A6NKB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX2A6NKB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX2A6NKB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCNX2A6NKB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCNX2A6NKB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX2A6NKB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms