Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACOD1A6NK06 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACOD1A6NK06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACOD1A6NK06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACOD1A6NK06 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACOD1A6NK06 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms