Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRABD2BA6NFA1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRABD2BA6NFA1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRABD2BA6NFA1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRABD2BA6NFA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRABD2BA6NFA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRABD2BA6NFA1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRABD2BA6NFA1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms