Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAP1LC3B2A6NCE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAP1LC3B2A6NCE7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAP1LC3B2A6NCE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MAP1LC3B2A6NCE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MAP1LC3B2A6NCE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MAP1LC3B2A6NCE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MAP1LC3B2A6NCE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP1LC3B2A6NCE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms