Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE9A4FU28 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE9A4FU28 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE9A4FU28 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE9A4FU28 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTAGE9A4FU28 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTAGE9A4FU28 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTAGE9A4FU28 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTAGE9A4FU28 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms