Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4D1N5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A4D1N5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4D1N5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A4D1N5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4D1N5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A4D1N5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4D1N5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A4D1N5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4D1N5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4D1N5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4D1N5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4D1N5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4D1N5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4D1N5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4D1N5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4D1N5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4D1N5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4D1N5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4D1N5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4D1N5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4D1N5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A4D1N5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4D1N5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4D1N5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4D1N5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4D1N5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4D1N5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A4D1N5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A4D1N5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4D1N5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
A4D1N5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4D1N5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
A4D1N5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4D1N5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4D1N5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4D1N5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4D1N5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A4D1N5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4D1N5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4D1N5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4D1N5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4D1N5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4D1N5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4D1N5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4D1N5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4D1N5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4D1N5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4D1N5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4D1N5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4D1N5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4D1N5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4D1N5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4D1N5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4D1N5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4D1N5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A4D1N5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A4D1N5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A4D1N5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A4D1N5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A4D1N5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A4D1N5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A4D1N5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A4D1N5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A4D1N5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
A4D1N5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A4D1N5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
A4D1N5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A4D1N5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A4D1N5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
A4D1N5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A4D1N5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A4D1N5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A4D1N5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A4D1N5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A4D1N5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A4D1N5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A4D1N5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A4D1N5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A4D1N5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A4D1N5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A4D1N5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A4D1N5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A4D1N5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A4D1N5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A4D1N5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms