Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBASA2RRP1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBASA2RRP1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NBASA2RRP1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBASA2RRP1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBASA2RRP1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBASA2RRP1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBASA2RRP1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms