Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
E2F8A0AVK6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
E2F8A0AVK6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
E2F8A0AVK6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
E2F8A0AVK6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E2F8A0AVK6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.57■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
E2F8A0AVK6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
E2F8A0AVK6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms