Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPW3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PPW3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PPW3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PPW3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PPW3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PPW3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PPW3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1W2PPW3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PPW3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1W2PPW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1W2PPW3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPW3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1W2PPW3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPW3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPW3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPW3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1W2PPW3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms