Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTI1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GTI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GTI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GTI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GTI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GTI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GTI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1B0GTI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A1B0GTI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1B0GTI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms