Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV4-1A0A0J9YWV2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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