Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2A2

PPIAL4C, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4C, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPIAL4CA0A0B4J2A2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPIAL4CA0A0B4J2A2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms