Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms