Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms