Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDY1Q9Y6F8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms