Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PLXND1Q9Y4D7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PLXND1Q9Y4D7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PLXND1Q9Y4D7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms