Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF3AQ9Y496 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms