Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRELID3BQ9Y3B1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms