Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
TNNQ9UQP3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNQ9UQP3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms