Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEU3Q9UQ49 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEU3Q9UQ49 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms