Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNPO2Q9UMS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms