Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRXN1Q9ULB1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRXN1Q9ULB1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms