Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP45Q9UL16 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP45Q9UL16 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms