Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN16Q9UKR8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms