Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNL1Q9UK58 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNL1Q9UK58 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms