Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH22Q9UJ99 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms