Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MBD1Q9UIS9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MBD1Q9UIS9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms