Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXTL2Q9UBQ6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXTL2Q9UBQ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms