Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CWC15Q9P013 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CWC15Q9P013 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CWC15Q9P013 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms