Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTEL1Q9NZ71 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms