Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TOR4AQ9NXH8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms